Образовательные программы Амурского музея составлены по следующим направлениям:
«Живые древние традиции» (знакомит с особенностями материальной и духовной культуры коренных жителей Нижнего Приамурья – нанайцев),
«Духовное наследие» (нацелена на широкую презентацию экспозиции, представленной в Зале славянской этнографии, и несёт большую воспитательную нагрузку. В игровой форме младшие школьники и воспитанники детских садов знакомятся с особенностями быта и культуры русского народа, историей народных традиций),
«Военная и трудовая доблесть отцов» (включает лекции, экскурсии, мероприятия, посвящённые Дням воинской славы Отечества, памятным и юбилейным событиям в истории страны, родного края и города),
«Красота родного края» (является ознакомление школьников с уникальной дальневосточной природой, воспитание патриотических чувств и чувства прекрасного, формирование у детей понимания необходимости бережного отношения к родной природе),
«Мир музея» (знакомит слушателей с отдельными выставками, музейными коллекциями и предметами. Главной целью этой программы является популяризация музейных фондов и воспитание у подрастающего поколения интереса к историческому прошлому своего народа, чувства уважения к его культуре).